Detta är inte bara inneburit att ljudkvaliteten på MP3-filer skulle fläckas, men också att filöverföringar till NetMD kan ta flera timmar. Det hjälpte inte att Sony inte tillhandahålla bra produktinformation till NetMD återförsäljare. Allt under denna tid NetMD återförsäljare berättade sina kunder att filer kan överföras från NetMD till sina persondatorer. Många människor hamnade ta bort sina ursprungliga filer på sina datorer efter överföringen bara att ta reda på senare att de inte kunde kopiera deras NetMD filer tillbaka på sina datorer.
Under 2004 gjorde Sony en mängd olika korrigeringar och uppgraderingar till sin Minidisc produktlinje med lanseringen av Hi-MD. Saker som USB tvåvägs filöverföringar kan nu göras. För första gången kunde inspelningar laddas upp från inspelaren till datorn men endast filer som spelades in i Hi-MD-formatet. Men för många tidigare Minidisc kunder det var för sent, eftersom alltför mycket skada hade gjorts för att Sonys trovärdighet. Förutom Sony, endast Onkyo ens brytt sig om att göra mini-komponentssystem och hemmastereo använder Hi-MD.
Men Kenwood, Teac, och Marantz har fortfarande MDLP system på marknaden, även om Hi-MD är bakåtkompatibel med tidigare Minidisc-format. Hi-MD innehåller 1 gigabyte minne och poster i PCM, annars känd som WAV. I april 2006, Sony kom ut med MZ-RH1 bärbara Hi-MD-spelare. Denna inspelare gick det extra steget, inte bara kunde Hi-MD inspelningar laddas upp utan även inspelningar som gjorts före införandet av Hi-MD kan laddas upp.
Utan uppenbart erkänna det, Sony gav MD-användare möjlighet att ladda upp alla sina MD-inspelningar till datorn så att filerna kan överföras till andra format som MD-ålder var nu närmar sig sitt slut. En hel generation i östra Asien har nu vuxit upp med hjälp av Minidisc-format. Många människor har blivit fansen. Många människor har inte hittat ett lönsamt alternativ för att göra realtids kopior av musik för uppspelning utan att kräva clunky intervention