Vilken som helst av de tillgängliga behandlingar är överlägsen alla andra och ingen enskild behandling är perfekt för alla patienter eller alla vårtor och inga definitiva bevis tyder på densamma. Användningen av lokalt utvecklade och övervakade behandlingsalgoritmer har associerats med förbättrade kliniska resultat och bör uppmuntras. På grund av osäkerhet om effekten av behandling på framtida överföring av HPV och möjligheten att spontana upplösning, är ett godtagbart alternativ för vissa personer att avstå från behandling och vänta på spontana upplösning.
Könsdelwarts förekommer ofta i grupper och kan ansamlas i stora massorna på genitala vävnader. De återkommer ofta efter behandling. Beroende på faktorer, såsom deras storlek och läge, det finns ett antal behandlingar av genitala vårtor. Små vårtor kan tas bort genom att frysa (flytande kväve) eller bränning (electrodessication) .För ta bort stora vårtor som inte har svarat på annan behandling kirurgi är ibland krävs. Operation för att avlägsna genitala vårtor kan fyllas på många olika sätt (inklusive via laser) med en kunnig vårdgivare.
Patienter med många eller stora vårtor kan behöva välja operation som ett alternativ. Kirurgi är också den enda behandlingsalternativ som i allmänhet kan ta bort en vårta med bara ett besök.
Efter en har genomgått behandling av genitala vårtor, de bör undersöka ett regelbundet för att övervaka nya vårtor. Tirus orsakar vårtor (HPV) inte går bort med behandling av genitala vårtor. Om vårtor kommer tillbaka, de brukar göra det inom tre till sex månaders behandling. Detta problem är vanligare hos kvinnor med nedsatt immunförsvar.
Undvika människor som har genitala vårtor eller HPV kan minska risken att smittas med HPV. Omdömen